ImageSurfer

Descripción

ImageSurfer es un programa de imágenes 3D gratuito para microcopia. Permite a los investigadores visualizar y analizar volúmenes multicanal 3D y 4D (lapso de tiempo). ImageSurfer proporciona varias herramientas de restauración de imágenes que incluyen algoritmos de deconvolución (filtro de Wiener, iterativo restringido y máxima probabilidad) para eliminar el desenfoque introducido por el sistema de imágenes. Para la visualización, ImageSurfer proporciona varias técnicas de renderizado de volumen y superficie. El software también tiene un innovador modo de isosuperficie coloreada que proporciona una visualización cualitativa de la correspondencia entre dos canales.

Un "extractor de cortes" permite al usuario examinar una sección transversal del volumen tomado en cualquier orientación. El corte capturado se puede visualizar como una imagen 2D tradicional o como una representación en relieve 3D en la que la intensidad de la imagen se codifica como altura. Para sondear aún más la superposición espacial entre estructuras, el investigador puede usar datos de otro canal para colorear la representación en relieve 3D. Para la cuantificación, los valores de intensidad de la señal se pueden muestrear en cortes capturados a lo largo de un spline definido por el usuario. Además de tomar instantáneas de representaciones 3D y generar películas, los modelos 3D también se pueden exportar como archivos OBJ o VRML (lenguaje de modelado de realidad virtual); Los archivos VRML se pueden ver en los navegadores web mediante un complemento gratuito. Ambos tipos de archivos se pueden importar a los populares programas de renderizado 3D para su posterior procesamiento y a Acrobat 3D para producir documentos que se pueden ver de forma interactiva con Adobe Reader 8.