POY

Descripción

POY es un programa de análisis filogenético que admite múltiples tipos de datos (por ejemplo, morfología, nucleótidos, genes y regiones de genes, cromosomas y genomas completos). POY es particular porque puede realizar una verdadera alineación e inferencia de filogenia, es decir, las secuencias de entrada no necesitan estar prealineadas. Las inserciones, eliminaciones y reordenamientos se pueden incluir en la puntuación general del árbol en Máxima parsimonia o en el modelo en Máxima probabilidad. Se han desarrollado una variedad de algoritmos heurísticos para este propósito y se implementan en POY.