Ascalaph Designer

Descripción

Acalaph Designer es un programa de propósito general para simulaciones dinámicas moleculares. Bajo un único entorno gráfico se representan como propia la aplicación de la dinámica molecular así como los métodos de la mecánica clásica y cuántica de programas populares. Las características incluyen gráficos moleculares: ventanas múltiples, dos cámaras por modelo, CPK, marco de alambre, palo, bola y palo, y estilos de marco de alambre CPK, construcción de modelos moleculares: constructor de cristales, constructor de cadenas, dibujo con el mouse, edición de geometría molecular, optimización preliminar , optimización cuántica y eliminación de conflictos, optimización de geometría molecular con métodos de gradiente conjugado, dinámica molecular: integración de pasos de tiempo múltiples, integración de cuarto orden, cálculos de supercomputadora con la ayuda de MDynaMix, modelo de agua SPC flexible y modelo de agua implícito, y química cuántica con ayuda de CP2K y PC GAMESS/Firefly: energía, optimización de geometría molecular y potenciales cargas derivadas.