CodonCode Aligner

Descripción

CodonCode Aligner es un software fácil de usar para ensamblar secuencias de ADN, alinear, editar contig y detectar mutaciones. Aligner es compatible con Phred-Phrap y es totalmente compatible con las puntuaciones de calidad de la secuencia, al tiempo que ofrece una interfaz de usuario familiar y fácil de aprender. Las funciones incluyen importar secuencias desde archivos de texto, alinear contigs entre sí manteniendo los enlaces a las trazas, encontrar mutaciones heterocigóticas, definir regiones de interés ("características"), importar y editar ensamblajes generados por Phrap, exportar secuencias y características, importar secuencias desde archivos ABI y SCF, recortar vectores, alinear con una secuencia de referencia, analizar inserciones y eliminaciones heterocigóticas, navegar entre funciones definidas por el usuario y exportar proyectos de ensamblaje compatibles con Consed.