GATE

Descripción

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) es una plataforma de software computacional integrada para el análisis y la visualización de series temporales biomoleculares de alta dimensión. GATE utiliza un algoritmo de agrupamiento basado en correlación para organizar series de tiempo moleculares en una matriz hexagonal bidimensional y colorea dinámicamente hexágonos individuales de acuerdo con el nivel de expresión del componente molecular al que están asignados, para crear películas animadas de molecular a nivel de sistemas. dinámica regulatoria. Para inferir posibles mecanismos de control regulatorio a partir de patrones de correlación, GATE también permite la interrogación interactiva de películas contra una amplia variedad de conjuntos de datos de conocimiento previo. Las películas GATE se pueden pausar y son interactivas, lo que permite a los usuarios reconstruir redes y realizar análisis de enriquecimiento funcional. Las películas creadas con GATE pueden guardarse en formato Flash e insertarse directamente en archivos PDF manuscritos como figuras interactivas.