RightField

Descripción

RightField puede especificar un rango de términos permitidos de una ontología elegida (subclases, individuos o combinaciones) para cada campo de anotación. La hoja de cálculo resultante presenta estos términos a los usuarios como una simple lista desplegable. Esto reduce la barrera de adopción para el uso de ontologías comunitarias, ya que la anotación la realiza el científico que generó los datos en lugar de un tercero, y la anotación se recopila en el momento de la recopilación de datos.

RightField es una aplicación Java independiente que utiliza Apache-POI para interactuar con documentos de Microsoft. Permite a los usuarios importar hojas de cálculo de Excel o generar nuevas desde cero. Las ontologías se pueden importar desde sus sistemas de archivos locales o desde el repositorio de ontologías de BioPortal. Se pueden marcar celdas individuales o columnas o filas completas con los rangos requeridos de términos ontológicos y se puede anotar una hoja de cálculo individual con términos de múltiples ontologías.

Una vez marcada y guardada, la hoja de cálculo habilitada para RightField contiene hojas "ocultas" con información sobre los orígenes y las versiones de las ontologías utilizadas en la anotación. Esta información de procedencia es importante en el caso de futuros cambios de ontología, que pueden desaprobar los valores ya elegidos, o pueden agregar opciones más detalladas y solicitar una nueva anotación. RightField está diseñado como una herramienta de administrador. Aumenta las hojas de cálculo que ya pueden ajustarse a plantillas específicas para estandarizar aún más la terminología.