GenoSuite

Descripción

GenoSuite es un marco desarrollado para el análisis proteogenómico. La estrategia basada en FDRScore se utiliza para integrar resultados de múltiples algoritmos de búsqueda. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) se desarrolla como parte del marco GenoSuite. PPT es para encontrar traducciones novedosas en genomas procarióticos y depende de los datos proteómicos basados ​​en espectrometría de masas y la secuencia del genoma relacionado. Las características incluyen configuración para 4 algoritmos de código abierto para realizar búsquedas en la base de datos para la identificación de péptidos y se puede elegir cualquier combinación de los 4 algoritmos, enumera los péptidos específicos de búsqueda del genoma (péptidos nuevos), se pueden visualizar coincidencias espectrales para la evaluación de calidad, enumera También se pueden generar las nuevas proteínas y los cambios en las anotaciones de proteínas existentes, y un contexto genómico visual de los nuevos péptidos.