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CF

compsort for Mac

Editor: Paul A. Wilson
Mac Free
Descargar v1.01 29 descargas
Versión1.01
Editor Paul A. Wilson
Fecha de lanzamiento25 ago 2008
Fecha Agregada11 ago 2004
Requisitos del sistema operativoMacintosh, Mac OS X 10.3
RequisitosMac OS X 10.3
Descargas totales29
PrecioFree

Descripción

Herramienta de línea de comandos para comparar archivos de datos delimitados por comas utilizando diferencias relativas para determinar las conformaciones más similares. Compsort compara los archivos de datos utilizando la diferencia relativa, calcula una puntuación de similitud, ordena las puntuaciones en orden ascendente (los valores más bajos representan una mayor similitud), guarda una cantidad X de puntuaciones bajas.

Los archivos de datos producidos por el usuario deben ser archivos de texto delimitados por comas. Cada archivo representa una molécula única. Cada fila en un archivo representa una conformación única de la molécula. La primera columna del archivo de datos debe ser una etiqueta única para la conformación representada por la fila. El resto de las columnas son descriptores numéricos, como medidas de espacio de distancia.

Las filas se comparan combinatoriamente entre archivos. Las etiquetas de comparación se concatenan y se guardan con las puntuaciones del conjunto de filas. Esto proporciona una forma de identificar las conformaciones que produjeron una puntuación de similitud dada.

El trabajo futuro incluye:

agregar interfaz GUI

publicar papel en mi algoritmo de modelado de farmacóforo 3D

Una versión paralela usando MPI

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Alternativas

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